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Prof. Dr. Mark Varrelmann
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Duration:
03/2021 – 02/2024
Project team:
PhD Omid Eini-Gandomani,
Prof. Dr. Mark Varrelmann
Department:
Funding:
Das Projekt wurde von der DFG (Deutsche Forschungsgemeinschaft) und in Zusammenarbeit mit KWS finanziert.
Cooperations:
KWS
Hintergrund
Geminiviren (Familie Geminiviridae) sind für die Vervielfältigung ihres Genoms auf die DNA-Replikationsmaschinerie des Wirts angewiesen. Sie müssen den Zellzyklus des Wirts in die S-Phase überführen, in der die DNA-Replikation und die homologiegeleitete DNA-Rekombination (HDR) stattfinden. In jüngster Zeit wurden geminivirale Replikone (GVR), darunter das Beet curly top virus (BCTV)-Replikon, für die effiziente Übertragung von CRISPR/Cas-Komponenten zur gezielten Genom-Editierung in Pflanzenzellen eingesetzt. Die genaue Rolle von GVRs auf dem HDR-Weg ist jedoch unbekannt. Ein besseres Verständnis der Auswirkungen von GVRs auf die Regulierung von HDR- und Zellzyklusgenen wird sowohl die virale homologe Rekombination als auch die HDR in Pflanzen erhellen.
Ziel dieses Projekts
Ziel dieses Projekts war es, die Rolle der BCTV-Gene bei der homologen Rekombination sowohl in Viren als auch in Pflanzen zu verstehen, um effizientere GVRs für die Genom-Editierung zu erzeugen.
Methodik
Entwicklung eines Modells auf der Grundlage einer Kombination des BCTV-Replikons und der Cotton leaf curl betasatellie (CLCB) zur Prüfung der Virusrekombination. Prüfung der Rolle der BCTV-Gene bei der Virusrekombination. Untersuchung der Reaktion von Zuckerrübenpflanzen auf die Virusinfektion mit Schwerpunkt auf Zellzyklus- und HDR-bezogenen Genen. Analyse der Auswirkung ausgewählter Gene auf ihre Wirkung auf die virale HDR.
Kooperationspartner

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